1. Th.S Nguyễn Thị Hồng Hà - Trưởng phòng
2. Th.S Nguyễn Thị Thu Quỳnh - Phó Trưởng phòng

Phòng Thanh tra Trường Đại học Quy Nhơn được thành lập vào tháng 12 năm 2004 với chức năng, nhiệm vụ: thanh tra, giám sát, giải quyết các khiếu nại, tố cáo. Kể từ nhiệm kỳ 2009-2014, Phòng Thanh tra phụ trách thêm công tác thi đua, khen thưởng và đổi tên thành Phòng Thanh tra và Công tác thi đua với chức năng, nhiệm vụ như sau: