Trường Đại học Quy Nhơn có sứ mệnh đào tạo, phát triển nguồn nhân lực chất lượng cao; bồi dưỡng nhân tài; nghiên cứu khoa học, truyền bá tri thức và chuyển giao công nghệ; phục vụ hiệu quả sự phát triển bền vững của đất nước, đặc biệt đối với khu vực Nam Trung Bộ - Tây Nguyên; góp phần thúc đẩy tiến bộ xã hội.
Công tác nghiên cứu khoa học tại Nhà trường đã và đang phục vụ cho nhu cầu nâng cao chất lượng đào tạo toàn diện, đáp ứng yêu cầu xã hội, thực hiện theo hướng kết hợp giảng dạy, học tập với ứng dụng những tri thức khoa học vào thực tiễn. Trong những năm vừa qua, Trường Đại học Quy Nhơn đã có những bước tiến đột phá cả về số lượng và chất lượng các nghiên cứu, công bố trong và ngoài nước.
Trong giai đoạn 2013 - 2018, nhà Trường đã chủ trì thành công nhiều đề tài cấp Quốc gia, cấp Bộ, cấp Tỉnh. Nghiên cứu khoa học cơ bản là lĩnh vực thế mạnh của Nhà Trường, và số lượng đề tài thực hiện trong lĩnh vực này ngày càng tăng nhanh chóng. Nhiều giảng viên của Trường trong lĩnh vực khoa học tự nhiên đã chủ nhiệm các đề tài cấp Quốc gia do Quỹ Phát triển Khoa học và Công nghệ Quốc gia tài trợ (Nafosted). Đáng chú ý, PGS.TS. Nguyễn Sum công tác tại Khoa Toán của Trường được nhận giải thưởng Tạ Quang Bửu và là một trong 2 tiến sĩ của Việt Nam nằm trong danh sách 100 nhà khoa học hàng đầu châu Á năm 2018 do Tạp chí Asian Scientist công bố. Bên cạnh đó, Nhà trường chú trọng liên kết, hợp tác với các cơ sở giáo dục đại học, viện nghiên cứu và địa phương để giải quyết các vấn đề thực tiễn nảy sinh. Ngoài ra, trong giai đoạn 5 năm qua Nhà trường đã ký kết hợp tác với Trường Đại học KU. Leuven chủ trì thực hiện 03 dự án do Vương quốc Bỉ tài trợ.
Cùng với việc sự phát triển mạnh nghiên cứu khoa học của giảng viên, tình hình nghiên cứu khoa học của sinh viên ngày càng tăng nhanh về số lượng và chất lượng. Các đề tài nghiên cứu khoa học được nghiệm thu đúng hạn với nhiều bài báo được công bố trên các tạp chí uy tín trong và ngoài nước. Với sản phẩm đề tài nổi trội như vậy nên hằng năm sinh viên của Trường nhận nhiều giải thưởng nghiên cứu khoa học cấp Bộ và học bổng của các tổ chức, công ty, xí nghiệp trao tặng.
Nhà trường cũng tổ chức nhiều hội thảo, hội nghị trong nước và quốc tế, thu hút sự quan tâm đông đảo của các nhà khoa học, nhà nghiên cứu đến từ các Trường Đại học, Viện nghiên cứu uy tín, các cơ quan, các bộ, ngành của quốc gia và quốc tế. Với đội ngũ cán bộ, giảng viên được đào tạo bài bản ở hầu hết các quốc gia có nền khoa học và giáo dục phát triển, cùng với cơ sở thiết bị nghiên cứu hiện có, hàng năm Nhà trường có hàng trăm công trình công bố trên tạp chí chuyên ngành quốc tế uy tín thuộc hệ thống ISI, nhiều giáo trình, chuyên khảo, sách tham khảo bằng cả tiếng Anh và tiếng Việt được xuất bản.
Với đặc thù là trường đại học đa ngành, đa lĩnh vực định hướng ứng dụng có uy tín cao, Nhà trường xem nhiệm vụ khoa học và công nghệ là một trong những nhiệm vụ trọng tâm, do đó từ năm 2016 đến 2020, tầm nhìn 2030 nhiệm vụ khoa học và công nghệ của Trường tập trung ưu tiên các vấn đề sau:
- Xây dựng các nhóm nghiên cứu mạnh cả về số lượng và chất lượng nhằm phát triển năng lực nghiên cứu, ứng dụng và chuyển giao công nghệ; trên cơ sở đó hướng đến xây dựng các Viện/Trung tâm nghiên cứu khoa học và ứng dụng xuất sắc trực thuộc Trường.
- Xây dựng và phát triển mối quan hệ Đại học - Doanh nghiệp, tạo điều kiện để các đề tài nghiên cứu khoa học trực tiếp phục vụ sản xuất, đáp ứng yêu cầu xã hội, đóng vai trò chủ đạo trong chuyển giao công nghệ phục vụ cho khu vực kinh tế trọng điểm miền Trung nói riêng và Việt Nam nói chung.
- Xây dựng và thực hiện các chương trình nghiên cứu khoa học liên ngành tầm cỡ quốc gia, phát huy vai trò trung tâm khoa học kỹ thuật, đẩy mạnh nghiên cứu khoa học cơ bản và nghiên cứu ứng dụng trong lĩnh vực năng lượng mới, năng lượng tái tạo, xử lý và bảo vệ môi trường; nghiên cứu các vấn đề về ứng phó với biến đổi khí hậu và nâng cao hiệu quả kinh tế biển; lĩnh vực kỹ thuật công nghệ, công nghệ thông tin - truyền thông và khoa học giáo dục và xã hội nhân văn.